فعاليتهای پژوهشی پژوهشكده شامل موارد متنوعی است كه در زيرمجموعه چهار مديريت سامان می يابد.
1. رئیس اداره انتشارات و نشریات؛
2. رئیس اداره پژوهش؛
3. گروه های علمی
4. رئیس اداره كتابخانه و اسناد.
برخي از فعاليتهاي پژوهشي پژوهشكده در سال های گذشته شامل موارد زير بوده است:
1. اجراي طرحهاي پژوهشي در حوزه مطالعاتي امام خميني(س) و انقلاب اسلامي؛
2. تهيه و تدوين متون درسي؛
3. انتشار كتاب؛
4. انتشار فصلنامه های علمي- پژوهشي؛
5. حمايت از پاياننامهها و رسالههاي دانشجويي سراسر كشور در حوزه تخصصي امام و انقلاب؛
6. همایش ها، برگزاري سخنرانيها و نشستهاي علمي؛
7. تدوين و نگارش پاياننامههاي مرتبط با امام و انقلاب اسلامي از سوي دانشجويان پژوهشكده؛
8. اطلاعرساني پژوهشي.
9. ارائه خدمات كتابخانهاي به اساتيد، محققان و دانشجويان؛
10. همكاري علمي با مراكز و سازمانهاي مرتبط با حوزه امام خميني(س) و انقلاب اسلامي؛
11. نظارت و ارزيابي فعاليتهاي پژوهشي؛